Refine knowledge brain workflow

Align the brain prompts, graph view, and startup defaults with the
latest phase 1 flow so local runs and navigation stay consistent.

README.md

@@ -33,16 +33,16 @@ start.bat
 ### 手动启动
 
 ```bash
-# 1. 配置 API Key
-cd backend
-cp .env.example .env
-# 编辑 .env，填入 ANTHROPIC_API_KEY
+# 1. 配置项目根目录环境变量
+cp backend/.env.example .env
+# 编辑项目根目录 .env
 
 # 2. 安装依赖
+cd backend
 uv sync
 
-# 3. 启动后端
-uv run uvicorn app.main:app --reload --port 8000
+# 3. 启动后端（按项目根目录 .env）
+uv run uvicorn app.main:app --reload --host "$HOST" --port "$PORT"
 
 # 4. 新终端，启动前端
 cd frontend
@@ -60,7 +60,7 @@ npm run dev
 
 ## API 文档
 
-后端启动后，访问 http://localhost:8000/docs 查看交互式 API 文档。
+后端启动后，访问 `http://<HOST>:<PORT>/docs` 查看交互式 API 文档（以项目根目录 `.env` 为准）。
 
 ### 主要接口